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高速冷冻离心机通常在第一次离心时把大局部不需求的大粒子沉降去掉。这时所需的组份大局部仍留在上清液中。然后将搜集到的上清液以更高速度离心,把所需的粒子堆积下来。离心的时间要选择得当,使大部份不需求的更小的粒子仍留在上清液中。关于得到的沉淀和上清液能够停止进一步的离心,直抵达到所需求的别离纯度为止。高速冷冻离心机的特性是操作简单,但别离纯度不高。依据样品中不同粒子所具有的不同的尺寸大小及沉降速度。大致步骤如下:在离心管中装入密度梯度溶液,溶液的密度从离心管顶部至底部逐步增加(正梯度)。将所需别离的样品当心地加至密度梯度溶液的顶部。高速冷冻离心机了解到样品在梯度溶液外表构成一负梯度。由于不同大小的粒子在向心力作用下,在梯度中挪动的速度不一样,所以经过离心后会构成几条分开的样品区带。高速冷冻离心机建议需要留意事项:样品粒子的密度必需大于梯度液注中任一点的密度。离心过程必需在区带抵达管子底部前中止。等密度离心法(isopycnic):依据粒子的不同密度来别离。高速冷冻离心机关于的离心过程中,粒子会移至与它自身密度相同的中央构成区带。密度样度的选择要使梯度的范围包括一切待别离粒子的密度。样品能够在密度梯度液粒上面或平均散布在密度梯度中。经离心后,样品粒子到达它们的均衡点。